研究標本亦屬於常見昆蟲的一部份,但有別於教學標本,這批標本所蒐藏之年代從1839年迄今,從日據時代開始由不同分類領域之國內外學者,將這些標本一一分類定名,除模式標本外為具有學名之昆蟲標本,目前本館保存約10萬件研究標本,大多已鑑定到種;研究標本之蟲籤除了一些基本的採集時間、採集地點與採集者外,還會有“鑑定者”之人名與其昆蟲學名。目前數位化方式也以科為主進而再深化科的數量。